Thermo Scientific™ Invitrogen Collibri Stranded RNA Library Prep Kit

Beschreibung

The Invitrogen Collibri Stranded RNA Library Prep Kit for Illumina Systems is designed for the robust construction of cDNA libraries for strand-specific RNA sequencing on Illumina next-generation sequencing (NGS) systems. The modules bring together the superior features of SuperScript IV Reverse Transcriptase, Dynabeads magnetic particles, and Platinum SuperFi DNA Polymerase, enabling users to obtain high-quality sequencing-ready libraries.

Das Invitrogen Collibri Strang-RNA-Bibliothekenvorbereitungskit für Illumina-Systeme wurde für den Aufbau robuster cDNA-Bibliotheken zur strangspezifischen RNA-Sequenzierung auf Illumina Sequenzierungssystemen der nächsten Generation (NGS) entwickelt. Die Module vereinen die überlegenen Eigenschaften der reversen Transkriptase SuperScript IV, Dynabeads magnetischen Partikeln und Platinum SuperFi DNA Polymerase, wodurch Anwender qualitativ hochwertige, sequenzierungsfähige Bibliotheken erhalten

Dieses Collibri Strang-RNA-Bibliothekvorbereitungskit unterstützt die schnelle Vorbereitung von mRNA oder Transkriptom-Bibliotheken in nur 4,5 Stunden durch Zugabe von 1 bis 25 ng mRNA-angereicherten oder Ribo-depletierter RNA-Proben. Das Multiplexing von Bibliotheken kann mit bis zu 96 einzeln indizierten oder einzigartigen doppelt indizierten Primern durchgeführt werden, was eine Single-Read- und Paired-End-Sequenzierung ermöglicht. Das Kit eignet sich für RNA-Proben verschiedener Qualität, einschließlich FFPE-Proben.

Visuelle Hinweise zur Prozessintegrität
Für maximalen Komfort sind visuelle Hinweise zur Prozessintegrität im gesamten Arbeitsablauf der Bibliotheksvorbereitung enthalten. Überwachen Sie den Fortschritt der Bibliothekserstellung mithilfe visueller Rückmeldungen von Farbstoffen in kritischen Reagenzien. Der Reaktionsmix ändert bei jedem Schritt durch das Hinzufügen kritischer Komponenten die Farbe, um bei der Herstellung der Bibliothek eine hohe Erfolgswahrscheinlichkeit zu gewährleisten. Die inerten Farbstoffe beeinflussen weder enzymatische Reaktionen noch beeinträchtigen sie Sequenzierungsergebnisse.

Funktionsweise
Mit Illumina kompatible Adapter in voller Länge werden durch PCR-Amplifikation unter Anwendung der Platinum SuperFi DNA-Polymerase eingeführt, um einzeln indizierte oder einzigartige doppelt indizierte Bibliotheken herzustellen, die mit Single-Read- und Paired-End-Sequenzierung kompatibel sind. Das Kit enthält 24 oder 96 einzeln indizierte, barcodierte PCR-Primer (i7), die mit einem Universal-i5-Primer oder einzigartigen doppelt indizierten PCR-Primern vorgemischt werden, die das Multiplexing von bis zu 96 Bibliotheken ermöglichen. Optimierte Reinigungsschritte entfernen effizient Restprimer und Adapter-/Primer-Dimere und bewahren gleichzeitig hohe Bibliotheksausbeuten.

Ein verwandtes Produkt, das Collibri Bibliotheksquantifizierungskit, wird für qPCR-basierte Quantifizierungen von Bibliotheken empfohlen, bevor mit der Sequenzierung fortgefahren wird.

Anwendungen
Das Collibri Strang-RNA-Bibliotheksvorbereitungskit wird für folgende Zwecke empfohlen:

• Genexpressionsuntersuchungen
• Alternative Spleißanalyse
• Erkennung und Entdeckung nicht-codierender RNA
• Identifizierung alternativer Polyadenylierungsstellen
• Erkennung von Genfusionen
• Erkennung von Transkript-Isoformen