Applied Biosystems™ SNaPshot™ Multiplex Kit

Beschreibung

Das SNaPshot® Multiplex Kit ist Teil des SNaPshot® Multiplex-Systems. Die Methode des SNaPshot® Multiplex Systems auf Basis der Primer-Erweiterung ermöglicht Multiplexing von bis zu 10 Einzelnukleotid-Polymorphismen (SNPs). Verwenden Sie dieses System, um SNPs zu untersuchen und zu bestätigen, kleinere Sequenzvariationen zu erkennen, die DNA-Methylierung zu beurteilen, BACs (Bacterial Artificial Chromosomes) zu analysieren oder allgemeine Markierungen von Restriktionsfragmenten zu erstellen.

• Abfragen von bis zu 10 SNPs aus verschiedenen Amplikonen in einer einzigen Single-Base-Extension-(SBE)-Reaktion
• Getrennte SNP-Loci, die sich um ein einzelnes Basispaar unterscheiden
• Erhöhte Empfindlichkeit im Vergleich zur Standardsequenzierung ermöglicht die Erkennung kleinerer Varianten (z. B. somatischer Mutationen) in einer Testprobe
• Reduzieren Sie die Komplexität Ihrer Experimente mit diesem anwenderfreundlichen und kostengünstigen Genotypisierungssystem
• Ein großer Teil der wissenschaftlichen Literatur demonstriert den Nutzen für Genotypisierung, Mutationsnachweis und Mapping

Das SNaPshot® Multiplex Kit ist Teil des SNaPshot® Multiplexsystems:
1) SNaPshot® Multiplex Kit (100, 1000, 5000 Reaktionsgrößen)
2) GeneScan™-120 LIZ™ Größenstandard
3) Matrix Standardset DS-02 für das Farbstoffset E5 passend für Ihr Gerät

Alle drei oben genannten Komponenten werden benötigt, um das SNaPshot® Multiplex Kit auszuführen. Das Matrix Standardset wird jedoch nur bei einer Ersteinrichtung benötigt, um das Gerät für das SNaPshot-spezifische Farbstoffset E5 zu kalibrieren.

4) GeneMapper® Software V4.0 (oder höher) ist die empfohlene sekundäre Datenanalyse-Software, die die Einrichtung benutzerdefinierter Panels und Bins für die automatisierte Datenanalyse ermöglicht.

Alternativ ist eine einfache, manuelle Peak-Analyse mit der PeakScanner™ 1.0-Software (kostenloser Download von der Website) für die Geräte 310, 3100, 3130 und 3730 möglich (PeakScanner ist nicht kompatibel mit Daten von 3500-Geräten). Bei den 3500-Geräten ermöglicht die primäre Datenanalyse-Software auf dem Gerät die Fragmentgrößenbestimmung und Farbtrennung ähnlich wie in PeakScanner.

5) Das SNaPshot Primer Focus Kit (4329538) ist ein nützliches Zubehörkit für Einzelexperimente oder die Einrichtung von Assays (Panel): Analysieren Sie die einzelnen Primer auf ihre ungefähre Größe. Dadurch wird bestimmt, ob zwei Oligonukleotide bei gleichzeitiger Ausführung überlappende Signale erzeugen, und es wird die Einstellung geeigneter Loci-Fenster (Bins) für GeneMapper Analysesoftware ermöglicht.

Screening und Bestätigung von SNPs
Das SNaPshot® Multiplex-System ist das perfekte Hilfsmittel für SNP-Screening und -Validierung. Das Kit umfasst ein Röhrchen mit Terminierungsreagenz und Einzelbasenerweiterung zur Markierung von DNA-Fragmenten. Lassen Sie zunächst DNA-Fragmente auf einem Applied Biosystems Kapillarelektrophorese-Instrument mit GeneScan™-120 LIZ® Größenstandard zur Bestimmung der Größe der markierten Fragmente laufen. Analysieren Sie dann mit der GeneMapper® Software die Daten und erzeugen Sie die Allele-Calls. Das SNaPshot® Multiplex-Kit ermöglicht Multiplexing bei der Single Base Extension (SBE) von bis zu 10 Primer-Vorlagen-Kombinationen in einem Kapillarformat mit Einzelröhrchen.

DNA-Methylierung beurteilen
Die Untersuchung von Methylierung und Epigenetik entwickelt sich zu einem wichtigen Bestandteil der Krebsforschung.⁄ In einem typischen Assay zur Analysierung der Methylierung desaminiert die Bisulfit-Behandlung von DNA nicht methyliertes Cytosin und wandelt es in Uracil um, während methyliertes Cytosin reaktionsfrei bleibt. Der nächste Schritt der PCR-Amplifikation konvertiert Uracil- in Thymin-Basen. Verwenden Sie SNaPshot®, um die Basisunterschiede in behandelten und unbehandelten Proben zu erkennen und den Methylierungsstatus Ihrer Proben zu erfahren.

Analyse von BACs
Neue BAC-Bibliotheken erfordern eine schnelle, effiziente Methode zur Charakterisierung (auch Fingerprinting genannt) und Zusammenstellung von Klonen zu Kontigs (zusammenhängende Konsenssequenzen), die dann in physikalische Karten des Chromosoms eingeordnet werden. Das SNaPshot® Multiplex Kit eignet sich für das Fingerprinting von Klonen durch Markierung von BAC-Fragmenten nach Verdau mit Restriktionsendonukleasen. Die markierten Fragmente können dann mit einem Applied Biosystems Kapillarelektrophorese-Instrument getrennt und nachgewiesen werden. Informationen zur Größenbestimmung von GeneMapper® Software Version 4.0 oder höher werden in nachfolgende Bearbeitungs- und Kontig-Montageprogramme importiert.

Auf ähnliche Weise kann jedes Restriktionsfragment mit einem Überhang von 5' mit der SNaPshot Reagenz mit einem fluoreszierenden Farbstoff markiert werden.

Bestellinformation

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