Invitrogen™ OncoStat Panel, SNAP-ChIP™ Spike-in

Beschreibung

• Snap-ChIP (Sample Normalization and Antibody Profiling Chromatin ImmunoPrecipitation) verwendet DNA-barcodierte halbsynthetische Nukleosome, die eindeutige Histon-Mutationen als Spike-in-ChIP-Kontrollen aufweisen.
• Homogene, vollständig definierte Standards repräsentieren zielgenau die Mononukleosome in den experimentellen Proben
• Nukleosome werden einer strengen Qualitätskontrolle bzgl. der Chargenkonsistenz unterzogen
• Einzigartige DNA-Barcodes können von experimentellen Probengenomen unterschieden werden
• Spike-ins bieten eine direkte Anzeige der Antikörperleistung in ChIP
• Möglichkeit zur Überwachung technischer Schwankungen zwischen Proben
• Definierte Standards ermöglichen eine universelle Normierung über Experimente hinweg
• SNAP-ChIP Panels sind direkt mit Ihrem aktuellen ChIP-Arbeitsablauf kompatibel, wobei halbsynthetische Nukleosome mit der jeweiligen Mutation zusammen mit dem Proben-Chromatin immunpräzipitiert und verarbeitet werden.
• Anwender können die Antikörperfähigkeit (Spezifität und Anreicherung) in einem ChIP-Experiment direkt durch Messung der Rückgewinnung von On- und Off-Target-Nukleosomen überwachen. Die SNAP Spike-ins können als definierter Standard weiter verwendet werden, um Ihre ChIP-Daten zu normalisieren und so die technische Variabilität über Experimente hinweg zu steuern.
• Das OncoStat Panel besteht aus einem Pool von Nukleosomen, die sieben gut untersuchte Histon-H3.3-Mutationen enthalten, die an Krebs beteiligt waren (Histon H3.3K4M, H3.3K9M, H3.3K27M, H3.3G34R, H3.3G34V, H3.3G34W und H3.3K36M) sowie eine Wildtyp-Kontrolle H3.3. Darüber hinaus wird jedes dieser acht Nukleosome von zwei unabhängigen DNA-Barcodes (insgesamt 16 Barcodes im Panel) umhüllt, was ein internes technisches Replikat in jeder ChIP-Reaktion ermöglicht.
• Mit einem einzelnen Spike-in des Panels kann der Anwendern die Antikörperspezifität prüfen, indem er die Post-IP-Rückgewinnung von On-Target- im Vergleich zu Off-Target-SNAP-ChIP-Nukleosomen untersucht und so die Generierung von qualitativ hochwertigen ChIP-Daten unterstützt.